count most abundant species (cases) in matrix using R

I want to use some basic exploratory commands for my dataset, but can't figure this one out: i want to be able to have the ten (or any other number) most abundant species returned to me based on my data-matrix.

So, species that are present in all sites (rows) end up high in the ranking, species that are present in only one site end up low (and may even be excluded based on the ten most abundant species).

Furthermore, each species has a number that corresponds with its abundacy within the site (row). I also want to be able to get a top ten most abundant species based on abundancy rahter then presence absesence.

Here i used dput to give you a part of my dataset.

structure(list(Hypnum.jutlandicum = c(1L, 0L, 18L, 0L, 18L, 43L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 68L, 8L, 0L, 0L, 0L, 0L, 68L), Cladonia.floerkeana = c(0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L), Dicranum.scoparium = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L), Deschampsia.flexuosa = c(0L, 
0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L), Carex.pilulifera = c(1L, 4L, 1L, 3L, 1L, 1L, 2L, 0L, 2L, 
0L, 0L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 0L, 0L), Polytrichum.commune = c(1L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L), Calluna.vulgaris = c(43L, 38L, 56L, 68L, 56L, 68L, 38L, 
88L, 68L, 38L, 68L, 88L, 38L, 38L, 18L, 8L, 18L, 38L), Danthonia.decumbens = c(1L, 
0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 
0L), Genista.pilosa = c(0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Polytrichum.juniperinum = c(0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 3L, 3L, 68L, 0L, 3L, 3L, 2L, 2L, 
0L, 0L), Micarea.erratica = c(1L, 3L, 4L, 4L, 1L, 1L, 4L, 8L, 
18L, 18L, 4L, 3L, 0L, 2L, 3L, 2L, 0L, 4L), Trapelia.coarctata = c(0L, 
0L, 4L, 0L, 0L, 0L, 4L, 4L, 8L, 8L, 8L, 2L, 2L, 8L, 0L, 0L, 2L, 
4L), Baeomyces.rufus = c(2L, 2L, 1L, 2L, 4L, 1L, 6L, 2L, 3L, 
0L, 3L, 8L, 68L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Porpidia.crustulata = c(0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 2L, 2L, 0L, 0L, 4L, 1L, 0L, 0L, 
0L), Catillaria.chalybeia = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 2L, 
0L, 3L, 3L, 0L, 0L, 2L, 0L, 1L, 0L, 0L), Rhizocarpon.reductum = c(0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 3L, 0L, 2L, 4L, 1L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 
0L), Porina.chlorotica = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
2L, 2L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Acarospora.fuscata = c(0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 3L, 1L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L), Dibaeis.baeomyces = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 3L, 
0L, 0L, 3L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L), Erica.tetralix = c(18L, 
2L, 1L, 0L, 31L, 1L, 2L, 3L, 1L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 68L), Campylopus.introflexus = c(1L, 38L, 0L, 0L, 1L, 0L, 
38L, 18L, 8L, 8L, 0L, 18L, 0L, 38L, 0L, 2L, 0L, 2L), Cladonia.coccifera = c(0L, 
4L, 4L, 0L, 1L, 1L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 3L, 0L, 1L, 0L, 0L, 
4L), Cladonia.grayi = c(0L, 2L, 1L, 0L, 1L, 1L, 0L, 2L, 2L, 0L, 
0L, 2L, 3L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Agrostis.vinealis = c(1L, 0L, 
1L, 0L, 0L, 1L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L
), Cladonia.macilenta = c(0L, 0L, 1L, 0L, 1L, 0L, 0L, 2L, 0L, 
0L, 0L, 2L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L), Polytrichum.piliferum = c(0L, 
0L, 18L, 38L, 0L, 1L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
3L, 0L), Rumex.acetosella = c(0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Cladonia.ramulosa = c(0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L), Hypochaeris.radicata = c(0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Molinia.caerulea = c(1L, 
2L, 1L, 4L, 8L, 1L, 3L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 3L, 3L, 2L, 2L, 3L, 
0L), Carex.arenaria = c(0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 2L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Cladonia.fimbriata = c(0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 2L, 2L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L
), Pinus.sylvestris = c(0L, 2L, 1L, 2L, 1L, 0L, 2L, 2L, 2L, 2L, 
1L, 2L, 2L, 8L, 2L, 2L, 18L, 0L), Quercus.robur = c(0L, 0L, 0L, 
1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), 
    Betula.pendula = c(0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Cephaloziella.divaricata = c(0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L), Pseudoscleropodium.purum = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Cladonia.humilis = c(0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 2L), Festuca.species = c(0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Brachythecium.rutabulum = c(0L, 
    0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L), Carex.panicea = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L), Sorbus.aucuparia.1 = c(1L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L), Ceratodon.purpureus = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L), Polytrichum.formosum = c(0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 2L, 0L, 0L, 0L, 3L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L), Bryum.capillare = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L), Lecidea.lithophila = c(0L, 
    0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L), Amelanchier.lamarckii = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L), Salix.aurita.1 = c(0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 1L), Cephaloziella.species = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Betula.pubescens = c(0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L), Lecidella.scabra = c(0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Calamagrostis.epigejos = c(0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L), Placynthiella.icmalea = c(0L, 4L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Geranium.robertianum = c(0L, 
    0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L), Micarea.lynceola = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Porpidia.soredizodes = c(0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L), Scoliciosporum.umbrinum = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Trapelia.obtegens = c(0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L), Deschampsia.flexuosa.2 = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Rubus.plicatus.1 = c(0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 
    0L, 0L), Bryum.spec. = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L), Cladonia.monomorpha.1 = c(0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L), Geisleria.sychnogonoides = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 8L, 0L, 0L, 4L), Micarea.lignaria = c(0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    0L, 4L)), class = "data.frame", row.names = c(274784L, 274553L, 
272517L, 275195L, 272514L, 274783L, 99L, 113L, 96L, 109L, 117L, 
102L, 114L, 97L, 138L, 133L, 95L, 237L))

I hope the question is clear, if not i will expand.